落叶松幼苗病害，主要是立枯病，这是在幼苗出土后发生的一种常见病害，一般在五、六月发生，持续时间较长。其病状分为猝倒型和根腐型两种。
猝倒型特征是：落叶松幼苗地表根茎部呈轮状腐烂，幼苗倒伏枯萎。
根腐型特征是：苗根腐烂、茎叶枯黄。有的种子幼芽在土壤里就受害腐烂，在被害苗周围土壤呈轮状菌丝体。
对于这种病害，具体防治办法有：
1.种子消毒法。在种子催芽处理埋藏前用赛力散拌种，每50千克种子加0.25千克赛力散，搅拌均匀后，用麻袋盖严，放一夜后，再进行催芽处理。也可以用硫酸铜水浸种，施用比例为50千克种子配以0.5千克硫酸铜。
2.土壤消毒法。在落叶松苗床覆沙前，把五氯硝基苯搅拌到沙子中，然后均匀撒于苗床上即可。施用量为每公顷18.75千克—22.5千克。
3.喷药防治法。波尔多液是防治落叶松幼苗病害效果较好的常用药，不论发病与否，均应施用。幼苗出土除草后立即喷洒，然后每隔7—10天再喷洒1次，要连续喷洒4—5次。药液浓度一般是1%—2%，浓度先低—些，以后随着喷洒次数的增多浓度可以再高一些。波尔多液要即配即用，不可存放时间过长，雨天或苗木茎叶有水时不宜施用，以免降低药效。
此外，五赛合剂(五氯硝基苯与赛力散以3：1的比例，再加200倍的水配制)、五代合剂(五氯硝基苯与代森锌以3：1的比例，加200倍的水配制)、代森特(配成1000倍溶液)以及0.5的明矾液等等，对防治落叶松立枯病效果较好。
